1) У меня стоит условие, что если файл выгрузки более 3072 кб и
содержит MD:
- запускать монопольно;
- ожидать выхода пользователей 300 сек;
- Впоследствии грубое отключение.

При загрузке в ПБ пишет:
0:30:41[MMO] - Вход в процесс загрузки
0:30:41[MMO] - Подготавливаем подключение к FTP-серверу
0:30:41[MMO] - Подключаемся к FTP-серверу
0:30:52[MMO] - Подключились к FTP-серверу
0:30:52[MMO] - Загружаем файл "/AutoExchange/PFC.zip" с FTP-сервера
0:32:26[MMO] - Записали файл как "F:\Base\CP\PFC.zip" [5396 КБайт] с FTP-сервера
0:32:26[MMO] - Удаляем файл с FTP-сервера
0:32:27[MMO] - Файл загружен с FTP.
0:32:27[MMO] - Отключаемся от FTP-сервера
0:32:27[MMO] - Отключились от FTP-сервера
0:32:27[MMO] - Размер файла больше допустимого для выполнения обновления в разделенном режиме!
0:32:27[MMO] - Создаем стоп-файл "F:\Base\URBDMasterStop"
0:32:27[MMO] - Пауза 300 сек., пусть выйдут все пользователи.
0:37:27[MMO] - Закрываем все открыте файлы по сети в каталоге ИБ...
0:37:27[MMO] - Выход из процесса загрузки

Загрузка не проходит....

2) Если при загрузке в ПБ выполнить реиндексацию, проверку логической и физической целостности, то после завершения этих процедур происходит выход из процесса загрузки. Файл обмена в базу не загружается.

3) Если в файле обмена присутствует МД, загрузка проходит без проблем, но изменения в конфигурацию ПБ не загружаются.
При ручной загрузки изменения загружаются.